डॉ। मेहर हसन आसिफ

प्रधान वैज्ञानिक

शोध में रूचि

समूह मुख्य रूप से पौधे के विकास के दौरान जीन अभिव्यक्ति विश्लेषण में शामिल रहा है और फल पकने और द्वितीयक मेटाबोलाइट उत्पादन पर विशेष जोर देता है। हमने जैव सूचना विज्ञान और आणविक जीव विज्ञान उपकरणों का उपयोग करके आणविक स्तर पर केले के पकने की जांच की है। हमारा समूह भी मूसा के भीतर विभिन्न जीन परिवारों के विकास का अध्ययन करने में रुचि रखता है। फलों के पकने के अलावा हम विटाहनिया सोम्निफेरा, पापावर सोमनीफेरम, अज़ादिराच्टा इंडिका और सोरेलिया जैसे औषधीय पौधों में द्वितीयक चयापचयों के जैवसंश्लेषण मार्ग के अध्ययन में भी शामिल हैं।

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डॉ। मेहर हसन आसिफ

प्रधान वैज्ञानिक

अनुसंधान विवरण

मुसप्पा में टीसीएस जीन परिवार का विकास

जीनोम-वाइड विश्लेषण के माध्यम से, हमने क्रमशः एम। एक्यूमिनटा और एम। बाल्बिसियाना में कुल 80 (25 एचके, 10 एचपीटी और 45 आरआर) और 72 (25 एचके, 5 एचपीटी और 42 आरआर) टीसीएस जीन की पहचान की। पहचाने गए जीनों के विश्लेषण से पता चला है कि अधिकांश जीन अत्यधिक संरक्षित हैं, लेकिन सूक्ष्म रूप से भी भिन्न हैं। तुलनात्मक अभिव्यक्ति विश्लेषण से केले के फल पकने के दौरान TCS सदस्यों के एक समूह की भागीदारी का पता चला। एक सह-अभिव्यक्ति नेटवर्क ने एचसी-एचपीटी और आरआर सदस्यों के प्रत्यक्ष इंटरैक्शन के साथ एक कार्यशील टीसीएस मॉड्यूल की पहचान की, इसके बाद सामान्य और एथिलीन प्रणाली में टीसीएस प्रोटीन मॉड्यूल के आणविक गतिशीलता विश्लेषण द्वारा, जिसने एथिलीन के साथ टीसीएस प्रोटीन के संरचनात्मक प्रक्षेपवक्र में महत्वपूर्ण परिवर्तन दिखाया। विश्लेषण एचके-एचपीटी और आरआरएस के साथ-साथ केला फल पकने के लिए अग्रणी अन्य सदस्यों के बीच संभावित बातचीत का सुझाव देता है।

मुसा spp में DCL, AGO और RDR जीन परिवारों का जीनोम विस्तृत विश्लेषण और लक्षण वर्णन.

RNA साइलेंसिंग एक क्रमिक रूप से संरक्षित तंत्र है जो पौधों में जीन अभिव्यक्ति और एंटीवायरल रक्षा को नियंत्रित करता है। डिसर जैसी प्रोटीन (DCL), (AGO), और RNA पर निर्भर RNA पोलीमरेज़ (RDR) RNA साइलेंसिंग के प्रमुख घटक हैं। हालांकि केला एक मोनोकोटाइलडॉन मॉडल प्लांट है, लेकिन केले में इन जीनों का कोई व्यवस्थित विश्लेषण और अभिव्यक्ति प्रोफाइलिंग नहीं की गई है। इस अध्ययन में, हमने केले में 4 एड 4 डीसीएल, 15 एजीओ और 4 आरडीआर जीन की पहचान की और अरबिडोप्सिस, टमाटर और चावल के साथ उनकी तुलना की। जीनों को तीन उपसमूहों में वर्गीकृत किया गया था जो कि विस्तृत जीनोग्राफिक विश्लेषण के आधार पर आगे जीन संरचना विश्लेषण, जीन अभिव्यक्ति, जीनोमिक स्थानीयकरण, डोमेन और इन जीनों में दोहराव का विश्लेषण किया गया था। वास्तविक समय की मात्रात्मक पोलीमरेज़ चेन रिएक्शन (पीसीआर) ने अभिव्यक्ति की जांच के लिए विभिन्न ऊतकों पर प्रदर्शन किया। केले की प्रजातियों के विकास में DCL, AGO, RDR जीन परिवार महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। पकने के अंतर्निहित तंत्र को बेहतर ढंग से समझने के लिए, हमने पकने की प्रक्रिया और मजेदार हमले के दौरान केले में परिवर्तन का मूल्यांकन करने के लिए एक अध्ययन किया।

आर्सेनिक तनाव के जवाब में भिन्नता के लिए एराबिडोप्सिस अभिगम का ट्रांसक्रिप्टोम विश्लेषण

यह काम डॉ। पीके त्रिवेदी के सहयोग से किया गया। इस अध्ययन के लिए Arabidopsis thaliana accessions Col-0 और Slavi -1 का उपयोग किया गया था। Col-0 AsV तनाव के प्रति प्रतिरोधी था और Slavi-1, AsV तनाव के प्रति संवेदनशील था। तुलनात्मक जीनोम-वाइड एक्सप्रेशन विश्लेषण ने क्रमशः Col-0 और Slavi-1 में 168 और 548 जीनों के अंतर अभिव्यक्ति को प्रकट किया, जिसमें 120 सामान्य अंतर व्यक्त जीन थे। रक्षा और तनाव-प्रतिक्रिया, परिवहन प्रणाली, विनियामक तंत्र और जैव रासायनिक प्रक्रियाओं से जुड़े कई जीनों के विपरीत पहुंच में अंतर अभिव्यक्ति दिखाई दी। अध्ययन तनाव की प्रतिक्रिया और आस तनाव के प्रति अनुकूलन रणनीतियों में शामिल प्रक्रियाओं के साथ जुड़े आणविक तंत्र में एक अंतर्दृष्टि प्रदान करता है।

डॉ। मेहर हसन आसिफ

प्रधान वैज्ञानिक

प्रकाशन

संचित, आर त्रिवेदी, एमएच आसिफ, पीके त्रिवेदी। 2018. एक संवर्धित चिकित्सा के रूप में आहार संयंत्र miRNAs: क्रॉस-राज्य जीन विनियमन। आरएनए जीव विज्ञान 5 (12), 1433-1439।

एस पांडे, आर गोयल, ए भारद्वाज, एमएच आसिफ, एसवी सावंत, पी मिश्रा। 2018. ट्रांसक्रिप्‍टॉम एनालिसिस, प्रिकेल डेवलपमेंट और इसकी सुरक्षा के लिए सोलनम विरुम डनल में डिफेंस और सेकेंडरी मेटाबॉलिज्म से लिंक प्रदान करता है। वैज्ञानिक रिपोर्ट 8 (1), 17092।

टी शुक्ला, आर खरे, एस कुमार, डी लखवानी, डी शर्मा, एमएच आसिफ, पीके त्रिवेदी। 2018. डिफरेंशियल ट्रांस्क्रिप्टोम मॉड्यूलेशन से अरबिडोप्सिस थलियाना एक्सेस में आर्सेनिक तनाव प्रतिक्रिया में भिन्नता होती है। खतरनाक सामग्री के जर्नल 351, 1-10।

एसके आर्य, वाईवी धर, एसके उपाध्याय, एमएच आसिफ, पीसी वर्मा। 2018. फेनोकोकस सोलनोप्सिस ट्रांस्क्रिप्टोम का डे नोवो लक्षण वर्णन और विकास और हार्मोन जैवसंश्लेषण के दौरान जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइलिंग का विश्लेषण। वैज्ञानिक रिपोर्ट 8 (1), 7573।

जी सिंह, वाईवी धर, एमएच आसिफ, पी मिश्रा। 2018. स्टेरोल ग्लाइकोसिलेट्रांसफेरेज़ एंजाइम के कार्यात्मक महत्व की खोज। लिपिड रिसर्च में प्रगति 69, 1-10।

एम किदवई, वाईवी धर, एन गौतम, एम तिवारी, आईजेड अहमद, एमएच आसिफ, पीके त्रिवेदी। 2019. अरबिडोप्सिस थालियाना में ओरिजा सैटिवा वर्ग III पेरोक्सीडेज (ओएसपीआरएक्स 38) ओवरएक्सिप्रेशन एपोप्लास्टिक लिग्निफिकेशन के कारण आर्सेनिक संचय को कम करता है। खतरनाक सामग्री के जर्नल 362, 383-393।

7. आर जाटान, एस तिवारी, एमएच आसिफ, सी लता। 2019. जीनोम-वाइड प्रोफाइलिंग छोले में सूखे के तनाव के दौरान स्यूडोमोनास पुतिडा-मध्यस्थता वाले miRNAs अभिव्यक्ति में व्यापक बदलाव का खुलासा करता है (सिसर एरीटिनम एल।)। पर्यावरण और प्रायोगिक वनस्पति 157, 217-227।